Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP1P29466 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP1P29466 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms