Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms