Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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