Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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LRRTM2O43300 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRTM2O43300 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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LRRTM2O43300 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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