Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PCH4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PCH4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PCH4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PCH4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PCH4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PCH4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PCH4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PCH4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms