Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms