Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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