Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CEP41Q9BYV8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP41Q9BYV8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms