Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms