Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAMP1Q96JM3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms