Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUFY3Q7L099 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms