Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms