Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATL3Q6DD88 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATL3Q6DD88 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms