Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms