Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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