Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCLAFQ15004 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms