Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HNF4GQ14541 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms