Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms