Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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