Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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