Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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