Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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