Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SLAMF1Q13291 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms