Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms