Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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