Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM32Q13049 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms