Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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