Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F1Q01094 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F1Q01094 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms