Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms