Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms