Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IDH3AP50213 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IDH3AP50213 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IDH3AP50213 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms