Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms