Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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