Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms