Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHCGRP22888 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHCGRP22888 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms