Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFD1P11586 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms