Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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