Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRCH4O75427 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRCH4O75427 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms