Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SCN2BO60939 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCN2BO60939 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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