Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHB6O15197 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms