Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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