Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms