Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms