Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC14Q49A88 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms