Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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