Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA3Q16787 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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