Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms