Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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