Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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