Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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